La Matriz de Liderazgo es el dispositivo más preciado de los Autobots y contiene toda su sabiduría, acumulada por generaciones, que posee una energía capaz de destruir un planeta entero, así como de restaurar la paz. Sólo un Prime puede abrirla y así desplegar su poder. La Matriz es pasada de Prime a Prime.
La Matriz fue custodiada por Alpha Trion, hasta encontrar un robot apropiado para llevarla y el elegido fue Optimus, sobre el cual se pensaba que llevaría a los autobots a "iluminar su hora más oscura", pero finalmente no fue así.
Inicialmente, Optimus antes de morir, le pasa la Matriz a Ultramagnus, su viejo amigo, pero antes que éste la agarre, cayó en manos de Hot Rod, quien más tarde se convertiría en Rodimus Prime, el sucesor de Optimus.